竹鼠黑牙都是食物和环境的原因造成的，主要是细菌或者真菌感染导致，传染性强。竹鼠天生有藏食的天性，喂食过多，水分过重，平时鼠池过于潮湿，从而滋生细菌感染。
正常情况下，竹鼠口腔有丰富的常驻菌群，大多数细菌在牙齿菌斑表面生长旺盛。牙菌斑的细菌主要是无运动能力的革兰氏阳性需氧菌。但在某些情况下（比如竹鼠由于缺钙牙齿不能正常啃咬），牙菌斑逐渐增厚，这为无运动能力的厌氧菌繁殖创造了条件，随着厌氧菌的不断增多，细菌菌群就具有了致病性，并通过牙龈炎引起牙髓疾病。
再次，牙齿损伤，比如竹鼠由于啃咬硬物导致的损伤。正常情况下，竹鼠的牙齿表面有一层牙釉质，牙釉质的作用是保护牙髓免受细菌感染。当釉质受损或牙齿断裂，牙髓暴露，就为细菌到达牙髓创造了条件，从而导致牙髓炎甚者形成脓肿。
通过实验室采样诊断，肉汤中培养，在显微镜观察下发现病鼠病样含细菌培养中不规则球状革兰阴性菌占绝对比例，而饲料、健康鼠及竹鼠鼠池含细菌培养中规则球状革兰阳性菌占绝对比例。由此推测为竹鼠场的区域性特定革兰阴性球菌引起具有传染性的黑牙病。
