目前竹鼠没有专门的疾病疫苗，这也是竹鼠等特种养殖区别于鸡鸭鹅等传统养殖的地方。预防疾病主要食物的饲喂。夏季喂西瓜皮、地桃花、茅草根、绿豆等清凉消暑饲料，冬春季节喂鸭脚木、猫抓刺、马甲子等止痛退热防感冒的青饲。平时多喂嫩竹枝、竹叶、竹竿，在精料中注意添加骨粉、EM菌。
1、摄入大量水分拉稀。2、饲料不新鲜或者霉变。3、“露水”饲料也极易引发竹鼠拉稀。4、冬季降温贼风受凉拉稀。5、环境潮湿，细菌滋生拉稀。
竹鼠全年繁殖2～3胎，每胎生1～6只，以3只居多。因为竹鼠的发情期为1-3天，间隔15-18天左右，如果发情期错过就要耽搁18天以上，受孕期45-60天左右，哺乳期夏天在30左右，冬天起码得35天以上，还有产仔多的，隔仔也很讲究，一次性给仔鼠断奶，母鼠很容易发生乳房炎，那样对母鼠以后的生育造成很不好的影响，或者长时间不受孕，所以，以此算来，一只性成熟的母鼠一年是产不到4胎的。
竹鼠常由于养殖户在给竹鼠搭配精饲料时，由于水份比例不适当，或者长期投喂精饲料而粗饲料少，竹鼠的挑食习惯等导致竹鼠出现拉便异常，少而且干、小，有些竹鼠的粪便还伴随有鲜红色血液，采食量下降，最后逐渐消瘦。
竹鼠过于肥胖可能是由于食量过大，营养过剩导致的。活动空间小，活动少，吃完睡睡完吃。
一、选用高产母竹鼠 二、提高分娩密度 三、增加活产仔数
很多人认为竹鼠整个眼睛有白色分泌物，都以为是上火导致，于是按照上火的的情况来清热解毒，谁知道并没有一点效果。时不时的有人会出现一只这样的竹鼠，但是很多人都很难判断出到底是什么疾病，如何造成的。其实这是非常可怕的竹鼠急性肺炎。
竹鼠怀孕期为40~60天左右产仔， 一般是55天，少于50天为早产难成活；超过60天，胎过大是问题胎也难成活，55天产出的最多。
产后第一时间保证多汁饲料的添加，产后一周视其奶水是否充足，添加中药催奶药物。也可用比较传统的方法就是用蚯蚓也叫地龙，用几条红色蚯蚓捣烂混在食物里投喂。
竹鼠常见体内寄生虫有：胃肠线虫和绦虫、球虫、蛔虫。
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