目前竹鼠没有专门的疾病疫苗，这也是竹鼠等特种养殖区别于鸡鸭鹅等传统养殖的地方。预防疾病主要食物的饲喂。
夏季喂西瓜皮、地桃花、茅草根、绿豆等清凉消暑饲料，冬春季节喂鸭脚木、猫抓刺、马甲子等止痛退热防感冒的青饲。平时多喂嫩竹枝、竹叶、竹竿，在精料中注意添加骨粉、EM菌。
竹鼠最大可以养到8斤左右，但是要养到这么大也不是那么简单的，需要科学的饲养管理。幼竹鼠（重量1斤内）-青年竹鼠（1-2斤）成年鼠（2.2-3.5斤性成熟，商品鼠（一般都有4斤以上），最大的可养到8斤左右，如今养殖技术的成熟，红颊竹鼠已突破10斤以上。
竹鼠感冒晚期有的甚至流有白色液体，流鼻血，呼吸困难，触摸鼠尾发凉，食欲减退拒食，鼻黏膜发炎，红肿，若不及时进行药物治疗容易转成肺炎(会出现有咳嗽或者听见风箱声)。最后因为不吃食物发展成肠炎，因为太瘦治好的效果已经非常低，最终会呼吸衰歇死亡。
在繁殖竹鼠的过程中，我们可能会遇到一个问题，其中最常见的就是竹鼠体重过重。对于这个问题，我们只有一种有效的解决方法，那就是帮竹鼠进行减肥。只有当竹鼠的体重达到一定的标准，也就是达到了配种的标准后，我们才能进行下一步的配种工作。
可以使用高锰酸钾消毒竹鼠鼠池，但需要注意使用方法和浓度。高锰酸钾是一种常用的消毒剂，但是不建议使用高锰酸钾消毒竹鼠池。因为高锰酸钾的氧化性强，会对竹鼠的皮肤和呼吸系统造成伤害。建议你使用其他消毒剂，如生石灰、漂白粉等。
竹鼠引种成活率达到95%才算正常，如果一家养殖场卖的竹鼠成活率达不到95%，不建议去引种。
竹鼠常见体内寄生虫有：胃肠线虫和绦虫、球虫、蛔虫。
1、食用过量生红薯会造成拉稀。2、竹鼠食用导致摄入大量淀粉在胃肠中发酵，气胀、消化不良。
如果竹鼠发生中暑现象，急救办法为：将竹鼠埋沙里，露出脑袋，往沙土上洒水，口灌葡萄糖或者十滴水。如果是幼竹鼠出现中暑怎么抢救：风油精涂鼻子，口灌十滴水，把竹鼠身体放水里，露出脑袋十分钟。
1、竹鼠总是怀孕率低、繁育能力下降。2、竹鼠产仔量少，1~3只，而高产可达3~5只。3、品系退化的很厉害，经过多代近亲繁殖后的竹鼠体质相对比较低，免疫力比正常竹鼠要低，易发病，抗应激能力、适应力下降和生长缓慢等。4、近亲繁殖竹鼠会出现双头一身体的竹鼠。
群养经常有竹鼠死亡是因为两个问题：1、竹鼠打架可能出现多只打架受伤而死。2、传染性疾病导致一个鼠池都传染。比如：细菌性、病毒性肠炎。
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